La Fondation Ensemble est gérée par un Conseil d'Administration composé de sept membres divisés en deux collèges :

Fondateurs

Président : Gérard Brémond
Fondateur Président-Directeur général du Groupe Pierre&Vacances

Vice-présidente : Jacqueline Délia-Brémond
Editrice

Olivier Brémond
Chef d'entreprise

Personnalités qualifiées

Michel Albert
Membre de l’Académie des Sciences Morales

Jacqueline Aloisi de Larderel
Ancien haut fonctionnaire des Nations Unies

Jean-Louis Servan-Schreiber
Président de Psychologies magazine

Gérard Worms
Associé gérant de banque

Un Bureau composé de trois membres, Président, Vice-présidente-Secrétaire et Trésorier, est constitué au sein du Conseil.

Pour valider ses décisions, notamment dans la sélection des projets, la Fondation s'appuie sur un collège d'experts .